准备好相关材料，如公司营业执照、股东会决议、清算报告等，向上海市工商局或各区工商局提交注销申请。工商部门会对提交的材料进行审查，如材料齐全且符合规定，将予以受理。

在工商部门受理注销申请后，需进行公示和清算。公示期一般为45天，期间如有债权人提出异议，需及时处理。同时，需按照清算报告对公司进行清算，确保公司资产和负债得到妥善处理。

经过公示和清算后，如无异议或异议已处理完毕，工商部门将出具注销证明。企业需凭此证明办理后续手续，如税务注销、银行账户注销等。